Pour remplir ses missions, la CNRF collabore avec divers partenaires qui opèrent dans les secteurs liés à la LCB/FT au niveau:
National comme:
- Association Des Banques & Etablissements Financiers Du Burundi (A.B.E.F)
- Réseau des Institutions Des Microfinances (R.I.M)
- Banque de la République Du Burundi (BRB)
- Association Des Assurances du Burundi
- Ministère de la Justice
- Ministère de l’intérieur, du Développement Communautaire et de la Sécurité Publique
- Inspection Générale de la Police
- Office Burundais des Recettes (OBR)
- Bureaux de Change
- Etablissements de Paiement
- Brigade Anticorruption
- Ordre des Professionnels Comptables (OPC)
- Association des Assurances Du Burundi
Régional comme l’ESAAMLG (Eastern and Southern Africa Anti-Money Laundering Group) et à travers des mémorendums d’entente avec divers pays
et International comme:
- Le GAFI/FATF
- Le Groupe Egmont
- UNODC : United Nations Office on Drugs and Crime